Я восстанавливал файлы, лежащие 3-им нижним слоем на диске, после разбиения, форматирования и интенсивного использования. С текстовыми файлами могут быть косяки, даже при видимом восстановлении читать их нельзя. Единственный способ гарантированного успеха, попытаться восстановить старое форматирование. Кажись, это делал R-Studio. Как настроить не помню, разбираться заново не охота, совет дать не могу.